De Ukendtes Skov fortæller historien om to brødre, Wirt og Greg, der farer vild; en mærkelig skov, der svæver frit i tiden. Med hjælp fra en klog gammel Skovhuggeren og en gnaven sangfugl ved navn Beatrice må Wirt og Greg rejse gennem det mærkelige land for at finde hjem.